サーバー機を交換しても調子が良くなかったのですが、コンソールのログを見てみると、今は使っていないSyncMateが裏で動いているっぽいのと、OSXvnc serverと画面共有が競合しているようなので、この二つの残骸を削除して見ました。その後は不具合が発生していないのでこれで大丈夫かも知れません。